Medicinali a base di oligonucleotidi. Oligonucleotidi antisenso

Medicinali a base di oligonucleotidi.  Oligonucleotidi antisenso

INTRODUZIONE

CAPITOLO 1. REVISIONE DELLA LETTERATURA.

1.1. Principali idee e modi per creare farmaci antitumorali mirati 15 1.1.1. Farmaci mirati in oncologia: farmaci a base di anticorpi monoclonali e oligonucleotidi antisenso.

1.2. Endocitosi mediata dal recettore e suo ruolo nel rilascio di composti biologicamente attivi alle cellule bersaglio

1.3. Sistemi alternativi per la somministrazione mirata di farmaci antitumorali per migliorare l’efficacia della terapia antitumorale.

1.4. Antigeni tumore-specifici come bersagli per la somministrazione mirata di farmaci antitumorali

1.5. Rilascio mirato di farmaci come parte di coniugati con molecole vettori proteiche e peptidiche.

1.6. Proteine ​​Chimeriche

1.7. Alfa-fetoproteina e suoi recettori come bersaglio per il rilascio selettivo di sostanze biologicamente attive alle cellule tumorali.

1.7.1. Struttura e funzioni dell'alfa-fetoproteina

1.7.2. Recettori per l'alfa-fetoproteina.

1.7.3. Frammenti biologicamente attivi di alfa-fetoproteina

1.8. Somministrazione mirata di farmaci antitumorali come approccio principale per superare la resistenza multifarmaco (MDR)

1.8.1. Il fenomeno della resistenza multifarmaco delle cellule tumorali.

1.8.2. Approcci moderni per superare la multiresistenza ai farmaci.

CAPITOLO 2. MATERIALI E METODI.

2.1. Isolamento dell'alfa-fetoproteina umana naturale e produzione di proteine ​​ricombinanti del frammento AFP.

2.1.1. Isolamento dell'AFP umana

2.1.2. Ottenere un frammento C-terminale ricombinante di AFP (gAFP27)

2.1.3. Preparazione della proteina PGA ricombinante

2.1.4. Ottenimento di un frammento ricombinante di AFP AFP-3BC

2.2. Sintesi di coniugati proteici e peptidici con FITC, citostatici e oligonucleotidi.

2.2.1. Sintesi di frammenti AFP, mAb e C-terminali marcati con FITC di AFP hAFP27 e AFP-3BC.

2.2.2. Sintesi dell'ottapeptide GIP8 AFP marcato con FITC.

EMTPVNPG (GIP8) con doxorubicina.

2.2.4. Sintesi di AFP coniugati con vinblastina.

2.2.5. Sintesi di coniugati di AFP con ftalocianine

2.2.6. Sintesi di coniugati AFP e GIP8 con esperamicina Aib (EsA).

2.2.9. Sintesi di coniugati di AFP con oligonucleotidi.

2.2.10. Preparazione di complessi ON con proteine.

2.3. Colture cellulari e condizioni di coltivazione.

2.4. Valutazione del legame recettoriale e dell'endocitosi di proteine, peptidi e coniugati marcati con fluorescenza mediante citometria a flusso.

2.4.1. Valutare il legame di AFP e Mab al recettore AFP.

2.4.2. Valutazione dell'endocitosi di AFP marcato con fluorescenza, frammento C-terminale di AFP, ottapeptide AFP GIP8.

2.5. Valutazione dell'endocitosi di coniugati proteici e peptidici con DOX mediante citometria a flusso.

2.6. Studi immunocitochimici e immunoistochimici.

2.6.1. Studio dell'espressione dei recettori AFP sulla superficie cellulare.

2.6.2. Studio dell'espressione delle proteine ​​c-Myc, Bc1-2 e Pgpl70.

2.6.3. Colorazione immunochimica di sezioni istologiche.

2.7. Studio dell'espressione di c-Myc, Bcl-2 e Pgpl70 nelle cellule tumorali.

2.7.1. Studio dell'espressione di c-Myc, Bcl-2 e Pgpl70 mediante Western blot.

2.7.2. Studio dell'espressione di c-Myc, Bcl-2 e Pgpl70 nelle cellule tumorali mediante citometria a flusso.

2.8. Microscopia a fluorescenza.

2.9. Determinazione dell'attività citostatica dei farmaci in vitro.

2.9.1. Determinazione della vitalità cellulare.

2.9.2. Determinazione dell'inibizione dell'attività proliferativa delle cellule.

2.9.3. Analisi del livello di apoptosi mediante microscopia a fluorescenza.

2.8.4. Determinazione dell'attività fotocitostatica e chemiocitostatica dei coniugati AFP con ftalocianine di alluminio (A1Pc) e cobalto (CoPc).

2.9. Studio dell'attività proliferativa delle cellule.

2.10. Analisi ciclo cellulare utilizzando la citometria a flusso.

2.11. Studio dell'attività antitumorale di farmaci in vivo.

2.12. Elaborazione statistica dei risultati.

CAPITOLO 3. RISULTATI E LORO DISCUSSIONE.

3.1. Studio dell'espressione del recettore dell'alfa-fetoproteina su linee cellulari tumorali umane.

3.1.1. Studio della specificità dei cloni mAb verso AFPR

3.1.2. Valutazione della quantità di AFPR su cellule tumorali umane coltivate in vitro.

3.2. Rilevazione immunochimica dell'AFPR su cellule e sezioni di tessuto

3.2.1. Studio dell'espressione dei recettori AFP sulla superficie delle cellule tumorali mediante immunocitochimica.

3.2.2. Colorazione immunoistochimica di sezioni di tessuto tumorale

3.3. Studio del legame e dell'endocitosi dell'AFP marcata con fluorescenza da parte di cellule tumorali in vitro.

3.3.1. Studio del legame dell'AFP al recettore sulla superficie delle cellule tumorali e dei linfociti normali sangue periferico umano utilizzando la citometria a flusso.

3.3.2. Studio dell'endocitosi dell'AFP in vitro mediante citometria a flusso e microscopia a fluorescenza.

3.4. L'uso dell'endocitosi mediata dai recettori per la somministrazione mirata di farmaci antitumorali: doxorubicina, vinblastina, esperamicina, ftalocianine.

3.4.1. Analisi dell'internalizzazione dei coniugati da parte delle cellule tumorali in vitro

AFP con antibiotici/citostatici sull’esempio della doxorubicina.

3.4.2. Studio dell'attività citostatica delle proteine ​​coniugate con doxorubicina in vitro.

3.4.3. Studio dell'attività antitumorale dei coniugati AFP con DOX in vivo.

3.4.4. Studio dell'attività fotocitostatica e chemiocitostatica dei coniugati di AFP con ftalocianine di alluminio (A1Pc) e cobalto

3.4.5. Studio dell'attività citostatica dei coniugati di AFP con alcuni altri antibiotici antitumorali (citostatici).

3.4.6. Studio dell'attività citostatica dei coniugati AFP con esperamicina Ajb (EsA) in vitro.

3.4.7. Studio dell'attività antitumorale dei coniugati AFP con esperamicina Aib (EsA) in vivo.

3.5. Superare la resistenza multifarmaco causata dall’espressione del gene MDR 1 utilizzando coniugati AFP con farmaci antitumorali in vitro.

3.5.1. Caratterizzazione di linee cellulari resistenti.

3.5.2. Analisi dell'internalizzazione della DOX e dei suoi coniugati proteici in linee cellulari resistenti.

3.5.3. Studio dell'attività citostatica dei coniugati DOX-AFP contro linee cellulari resistenti.

3.6. Frammenti biologicamente attivi di AFP.

3.6.1. Frammento C-terminale ricombinante dell'AFP (gAFP27).

3.6.2. Frammento C-terminale ricombinante di AFP AFP-ZVS.

3.6.3. Octapeptide biologicamente attivo - frammento AFP

3.7. Rilascio mirato di oligonucleotidi antisenso alle cellule tumorali.

3.7.1. Rilascio mirato di oligonucleotidi antisenso alle cellule tumorali sotto forma di loro coniugati con AFP.

3.7.2. Studio dell'efficacia della somministrazione di ASON utilizzando complessi non covalenti con AFP.

Elenco consigliato delle tesi

  • Creazione e studio delle proprietà di proteine ​​umane ricombinanti con potenziale effetto antitumorale 2007, candidata alle scienze chimiche Savvateeva, Lyudmila Vladimirovna

  • Sviluppo di farmaci antitumorali mirati basati su vettori peptidici e agenti antiangiogenici 2007, Dottore in scienze biologiche Feldman, Natalia Borisovna

  • Utilizzo del dominio C-terminale dell'alfa-fetoproteina per la somministrazione mirata di farmaci antitumorali 2012, Candidato di scienze biologiche Godovanny, Artem Vitalievich

  • Ottenimento e studio dell'attività biologica dei coniugati del fattore di crescita epidermico con farmaci chemioterapici antitumorali 2000, candidato alle scienze biologiche Gumanov, Sergey Georgievich

  • Sintesi di coniugati di α-fetoproteina umana con farmaci antitumorali per la somministrazione mirata alle cellule tumorali 2001, Candidato di scienze chimiche Zabolotnev, Dmitry Viktorovich

Introduzione alla tesi (parte dell'abstract) sul tema "L'uso di vettori proteici e peptidici per il rilascio selettivo di farmaci antitumorali e oligonucleotidi terapeutici alle cellule tumorali"

L'urgenza del problema. Le ragioni principali dell'insufficiente efficacia del trattamento chemioterapico delle malattie oncologiche sono la bassa biodisponibilità degli agenti antitumorali per il tumore, la necessità di utilizzare dosi elevate di farmaci e la natura non selettiva di questi farmaci. La limitata penetrazione dei farmaci nei tumori biologicamente eterogenei porta alla sopravvivenza di una parte delle cellule tumorali, anche dopo trattamento a lungo termine con agenti citotossici. Il trattamento con dosi elevate, necessarie per la remissione completa, provoca gravi effetti collaterali sistemici, che spesso costringono i pazienti a interrompere il trattamento. Oltretutto, uso a lungo termine Gli agenti chemioterapici sono irti dello sviluppo di resistenza multifarmaco, che rende i farmaci utilizzati inefficaci. Il fenomeno della resistenza ai farmaci si basa su meccanismi intracellulari di varia natura, come una diminuzione del trasporto dei farmaci attraverso la membrana plasmatica, una violazione del livello di espressione degli oncogeni, danni ai sistemi di trasduzione del segnale, ecc. Per aumentare l'efficacia della terapia tumorale è necessario aumentare la selettività dell’azione dei farmaci. Si possono distinguere due direzioni: lo sviluppo di nuovi farmaci altamente selettivi e la creazione di nuovi sistemi per il trasporto regolato di noti composti antitumorali nelle cellule bersaglio.

La selettività dell'azione di un farmaco può essere aumentata utilizzando agenti mirati nei sistemi di rilascio: molecole che possono legarsi a determinanti specifici sulla superficie cellulare. Pertanto, l'uso del componente mirato determina l'interazione del sistema di rilascio selettivo con cellule e tessuti rigorosamente definiti, in particolare cellule tumorali. I ligandi fisiologici dei recettori dei fattori di crescita o delle proteine ​​oncofetali possono agire come agenti o vettori mirati; stessi fattori di crescita e proteine ​​oncofetali. Il farmaco antitumorale può essere legato al vettore in modo covalente per formare un coniugato, o in modo non covalente per formare un complesso forte. Il legame di una molecola bersaglio a un recettore specifico sulla superficie cellulare induce il processo di endocitosi mediata dal recettore, che garantisce l'accumulo di un farmaco da parte delle cellule tumorali, il cui bersaglio molecolare si trova all'interno della cellula.

Va notato che in alcuni casi l'uso di sistemi di rilascio selettivo è l'unico modo per sfruttare il potenziale terapeutico di alcuni antibiotici antitumorali altamente tossici, ad esempio gli antibiotici della serie enediyne. Un esempio è il farmaco Mylotarg, che è un coniugato della calichemiacina Xi con anticorpi umanizzati contro CD33. Inoltre, l’uso di sistemi di rilascio altamente efficienti può aumentare significativamente l’effetto terapeutico degli oligonucleotidi antisenso, che purtroppo non hanno ancora trovato applicazione nella pratica clinica.

La soluzione efficace del problema del trasporto mirato di farmaci basato sull'endocitosi mediata dai recettori è determinata, innanzitutto, dalla scelta di una molecola vettore. I vettori proteici devono soddisfare una serie di requisiti di base, tra cui l'elevata affinità dei vettori per i corrispondenti recettori sulla superficie delle cellule bersaglio del tumore, l'elevata stabilità, la possibilità della loro modificazione chimica mediante coniugazione con farmaci chemioterapici senza perdita di proprietà biologiche e la disponibilità di proteine ​​in quantità preparabili. La proteina oncofetale alfa-fetoproteina corrisponde maggiormente a questi requisiti. Fattori importanti nella progettazione di sistemi di rilascio selettivo sono anche la scelta di un farmaco (agente citostatico, fotosensibilizzatore, oligonucleotide antisenso) e di un linker che collega i componenti bersaglio e citostatici. Lo screening dei costrutti creati nel sistema in vitro e lo studio del loro comportamento intracellulare consentono di identificare le varianti più ottimali dei sistemi di consegna.

Lo scopo di questo lavoro era sviluppare principi per la creazione di sistemi per la somministrazione selettiva di farmaci antitumorali e oligonucleotidi terapeutici alle cellule tumorali basati su proteine ​​e peptidi naturali e ricombinanti e identificare modelli che ne determinano l'efficacia. Gli obiettivi della ricerca:

Selezione di molecole vettoriali proteiche e peptidiche per il rilascio selettivo di farmaci antitumorali e oligonucleotidi antisenso;

Creazione di costrutti per il rilascio selettivo di farmaci antitumorali alle cellule bersaglio basati sull'alfa-fetoproteina e sui suoi frammenti peptidici,

Studio dell'internalizzazione e della distribuzione intracellulare dei farmaci in funzione della tipologia costruttiva per ottimizzare i sistemi di veicolazione;

Sviluppo di approcci per superare la multiresistenza ai farmaci utilizzando sistemi di somministrazione mirati; Sviluppo di costrutti basati su alfa-fetoproteina e fattore di crescita epidermico per il rilascio selettivo di oligonucleotidi antisenso e valutazione della loro efficacia.

Novità scientifica e significato pratico.

La presenza dei recettori AFP è stata dimostrata sia sulla superficie di cellule di linee tumorali umane che su sezioni istologiche di tumori maligni umani (ovaio, mammella, fegato, stomaco, intestino). Su sezioni di tumori benigni e tessuti normali, nonché sulla superficie dei linfociti a riposo isolati dal sangue di volontari sani, non è stato trovato il recettore AFP. Pertanto, il recettore AFP può essere utilizzato come marcatore tumorale per un’ampia gamma di tumori maligni e gli anticorpi contro il recettore possono essere utilizzati per diagnosticare i tumori.

È stato formulato e sviluppato il concetto di un sistema per la somministrazione mirata di composti biologicamente attivi alle cellule bersaglio utilizzando l'AFP e i suoi frammenti peptidici come motivo mirato.

Sono stati sviluppati metodi che consentono esperimenti in vitro in colture cellulari per prevedere l'efficacia dei farmaci con azione selettiva.

È stato scoperto per la prima volta che il frammento ricombinante C-terminale dell'AFP (da 357 a 590 a.a.) si lega specificamente al recettore dell'AFP, viene endocitato dalle cellule tumorali come l'AFP e, analogamente all'AFP, inibisce la crescita dell'ormone indotta dall'estradiolo cellule tumorali dipendenti. Pertanto, questa proteina ricombinante può essere utilizzata come molecola vettore in sistemi di rilascio mirati.

Creato costrutti genici per la biosintesi indotta di frammenti C-terminali di AFP in E. coli. Sono stati sviluppati metodi altamente efficienti per isolare frammenti di AFP ricombinanti.

Per la prima volta è stata dimostrata la capacità del frammento biologicamente attivo dell'AFP-ottapeptide GIP8 (472-479 a.a.) di legarsi selettivamente alla superficie delle cellule tumorali e di essere internalizzato da esse con elevata efficienza, il che apre la possibilità di utilizzando GIP8 come vettore nei sistemi di consegna mirati.

È stata dimostrata l'efficacia e la selettività dell'attività antitumorale dei coniugati AFP, AFP-ZVS e GIP8 in vitro contro un'ampia gamma di linee cellulari tumorali umane. Sono state studiate le regolarità della loro traslocazione intracellulare, è stata dimostrata la dipendenza dell'efficacia dell'azione coniugata dalla labilità del legame chimico tra la proteina e l'agente citostatico.

Quando si utilizzano sistemi di rilascio mirato basati sull'AFP, è stata trovata la possibilità di superare la resistenza multifarmaco delle cellule tumorali grazie all'attività di Pgpl70.

L'elevata efficacia antitumorale del coniugato AFP con esperamicina Aib è stata dimostrata per la prima volta in vivo.

Sono stati sviluppati sistemi per il rilascio selettivo di oligonucleotidi terapeutici ed è stata dimostrata la possibilità fondamentale e la promessa di utilizzare vettori proteici (AFP e fattore di crescita epidermico) per il loro rilascio mirato alle cellule tumorali.

Le principali disposizioni per la difesa:

1. Il recettore AFP è un antigene tumore-specifico unico, presente sulla superficie delle cellule tumorali e assente nella maggior parte delle cellule normali.

2. Il recettore dell'alfa-fetoproteina può fungere da bersaglio per la terapia antitumorale selettiva. Legandosi specificamente al suo recettore, l'alfa-fetoproteina viene internalizzata dalle cellule tumorali insieme a molecole di composti farmacologici ad essa legati covalentemente, garantendo così il rilascio selettivo dei farmaci alle cellule tumorali.

3. L'uso di sistemi di rilascio mirato basati sull'alfa-fetoproteina consente di superare la resistenza multifarmaco delle cellule tumorali causata dai trasportatori ABC della membrana plasmatica.

4. I frammenti di alfa-fetoproteina ricombinante contenenti un motivo di legame del recettore possono essere utilizzati in sistemi di rilascio selettivi al posto della proteina naturale a lunghezza intera.

5. L'uso di vettori proteici (AFP e fattore di crescita epidermico) può aumentare significativamente l'efficienza del rilascio intracellulare di oligonucleotidi antisenso.

Il contributo personale dell'autore consiste nello sviluppo dell'idea, organizzazione e conduzione di studi sperimentali, analisi, generalizzazione e interpretazione dei risultati ottenuti. Tutti gli esperimenti con colture cellulari sono stati eseguiti direttamente dall'autore. Approvazione del lavoro.

I principali risultati del lavoro sono stati riportati al V International Symposium on Biology and Clinical Utilities of Tumor Markers (1995, Barcellona, ​​Spagna), XVI Intern.

Congresso di Chimica Clinica, (1996, Londra), The interdependence of Tumor Biology and Clinical Oncology (1996, Coronado, USA), p. 121.Riunione della Società Internazionale di Biologia e Medicina dello Sviluppo Oncologico (ISOBM) (1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2005), Conferenza europea sul cancro ECCO (1997, Francia), Congresso nazionale russo "Uomo e medicina" (2000, 2005, Mosca), 37° incontro scientifico annuale della Società europea per le indagini cliniche (2003, Verona, Italia), 1a conferenza EUFEPS sull'ottimizzazione della somministrazione e della formulazione dei farmaci: nuove sfide nella somministrazione dei farmaci (2003, Versailles, Francia), Il 5° workshop ISTC/Corea sulla biotecnologia (2004, Chungbuk, Corea), Conferenza mondiale sui proiettili magici (2004, Norimberga, Germania), conferenza internazionale Medicina molecolare e biosicurezza (2005, Mosca), III Congresso internazionale di Mosca "Biotecnologia: status e prospettive di sviluppo" (2005, Mosca), Conferenza internazionale di Mosca "Biotecnologia e medicina" (2006, Mosca), 19° incontro dell'Associazione europea per il cancro Research (EACR), Budapest, Ungheria, 1-4 luglio 2006, conferenza "Nuova piattaforma tecnologica per la ricerca biomedica (biologia, sanità, farmacia)" (2006, Rostov-sul-Don), I internazionale conferenza scientifica e pratica"Metodi di analisi postgenomica in biologia, laboratorio e medicina clinica" (2010, Mosca).

La struttura e lo scopo della tesi. Il lavoro è presentato su 256 pagine di testo dattiloscritto e consiste in un'introduzione, revisione della letteratura, descrizione dei metodi di ricerca, presentazione e discussione dei risultati, conclusione, conclusioni e un elenco di riferimenti, che comprende 406 fonti. La tesi contiene 94 figure e 14 tabelle.

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  • Frammenti ricombinanti di alfa-fetoproteina umana per la creazione di farmaci mirati 2012, Candidata di scienze biologiche Sharapova, Olga Andreevna

  • Costruzione di complessi acido-proteina nucleico per il trasporto mirato di DNA estraneo nelle cellule 2010, candidata di scienze biologiche Tatarinova, Olga Nikolaevna

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  • Ottenimento e studio del potenziale antitumorale di polipeptidi antiangiogenici e farmaci chemioterapici mirati 2006, candidato alle scienze biologiche Digtyar, Anton Vasilyevich

Conclusione della tesi sull'argomento "Biochimica", Posypanova, Galina Aronovna

1. È stato sviluppato il concetto di un sistema per la somministrazione mirata di composti biologicamente attivi alle cellule tumorali, in cui l'alfa-fetoproteina (AFP) e i suoi frammenti vengono utilizzati come motivo mirato.

2. La presenza di recettori AFP è stata accertata sia sulla superficie delle cellule di linee tumorali umane che su cellule di tumori maligni umani (ovaio, mammella, fegato, stomaco, intestino). Su sezioni di tumori benigni e tessuti normali, nonché sulla superficie dei linfociti di volontari sani, non è stato trovato il recettore AFP.

3. È stato dimostrato che non solo l'AFP, ma anche i suoi frammenti ricombinanti C-terminali si legano specificamente al recettore dell'AFP e vengono endocitati dalle cellule tumorali.

4. Si è scoperto che il frammento biologicamente attivo dell'AFP, l'ottapeptide GIP8, si lega selettivamente a un recettore sconosciuto sulla superficie delle cellule tumorali, viene internalizzato con elevata efficienza e può essere utilizzato come vettore in sistemi di rilascio mirati.

5. È stato stabilito che i coniugati dei farmaci antitumorali con AFP vengono accumulati selettivamente dalle cellule bersaglio, hanno un effetto citostatico pronunciato sulle cellule tumorali e hanno una bassa tossicità per le cellule umane normali; l'efficacia dei coniugati è determinata dalla labilità del legame chimico tra la proteina e l'agente citotossico.

6. L'uso di sistemi di rilascio mirato basati su AFP rende possibile superare la resistenza multifarmaco delle cellule tumorali dovuta all'attività Pgpl70.

7. L'efficienza del trasporto della doxorubicina nelle cellule tumorali nella composizione dei coniugati con AFP supera significativamente l'efficienza del suo trasporto nella composizione dei coniugati con transferrina e albumina sierica.

8. L'elevata attività antitumorale del coniugato AFP con esperamicina Aib in vivo è stata dimostrata utilizzando un modello di tumore di topo trapiantato (guarigione -30%, aumento dell'aspettativa di vita - 163%).

9. Il coniugato del frammento GIP8 AFP con la doxorubicina si accumula selettivamente nelle linee cellulari tumorali sensibili e resistenti, ha un effetto citostatico pronunciato sulle cellule tumorali e presenta una bassa tossicità per i leucociti mononucleati umani.

È stato dimostrato l'uso di vettori proteici basati su AFP e fattore di crescita epidermico per il rilascio mirato di oligonucleotidi antisenso alle cellule bersaglio.

Conclusione.

Questo lavoro è dedicato allo studio delle regolarità nella progettazione di sistemi di somministrazione mirata di farmaci basati su vettori proteici. Lo studio delle caratteristiche della traslocazione intracellulare dei farmaci studiati, il loro confronto con l'attività biologica contro il tumore e le cellule normali in vitro aiuta a prevedere il successo di una particolare strategia e, quindi, a ottimizzare il processo di creazione di farmaci antitumorali selettivi efficaci.

L'uso del componente mirato determina l'interazione del SAD con cellule e tessuti rigorosamente definiti, garantendo così la selettività dell'azione del farmaco. Il meccanismo dell'endocitosi mediata dai recettori favorisce l'accumulo di un farmaco il cui bersaglio molecolare è localizzato all'interno della cellula.

Il confronto di SAD, che sono coniugati (proteina vettoriale)-linker-(farmaco), in cui albumina sierica, transferrina e alfa-fetoproteina sono state utilizzate come proteina vettore, ha mostrato il vantaggio di quest'ultima sia in termini di capacità di accumularsi da parte del tumore cellule e in termini di attività citotossica per queste cellule. Questi coniugati utilizzavano idrazide dell'acido 3-maleimidobenzoico come legante e doxorubicina come farmaco. Detto linker è acido labile e può subire idrolisi in compartimenti cellulari quali endosomi e lisosomi, liberando così il farmaco dal SAD. La doxorubicina, un antibiotico del gruppo delle antracicline, è un agente terapeutico efficace e ampiamente utilizzato. Esistono due meccanismi principali attraverso i quali il farmaco provoca la morte cellulare: l'intercalazione nel DNA, a seguito della quale DOX viene inserito tra due nucleotidi adiacenti, fornendo una forte interazione con il DNA e interrompendo la replicazione e la trascrizione; legame e inibizione della topoisomerasi II. A causa della presenza di un gruppo chinone nella struttura, DOX è coinvolto nei processi redox, che portano alla formazione di radicali liberi che inducono danni al DNA e perossidazione lipidica. L'efficacia della terapia DOX dipende dal suo accumulo intracellulare.

Il DOX libero, grazie alla sua idrofobicità, penetra rapidamente nelle cellule e nei nuclei cellulari. La velocità di assorbimento della DOX da parte delle cellule nella composizione del coniugato è determinata dal numero di recettori specifici sulla superficie delle cellule bersaglio e dall'intensità dell'endocitosi mediata dai recettori.

Come proteine ​​vettore (componenti mirati), oltre all'AFP, abbiamo utilizzato le ben note proteine ​​di trasporto HSA e Trf, che vengono attivamente endocitate dalle cellule tumorali e vengono utilizzate con vari gradi di successo per la somministrazione intratumorale di farmaci (vedere Revisione della letteratura, Sezione 1.5). Tuttavia, il coniugato AFP con DOX era significativamente superiore a coniugati DOX simili con HSA e Trf sia in termini di efficienza di accumulo nelle cellule tumorali che di attività citotossica contro queste cellule.

Lo studio dell'espressione del recettore AFP sulla superficie delle cellule di linee tumorali umane e dei linfociti normali del sangue periferico, nonché su sezioni istologiche di tessuti cancerosi, benigni e normali utilizzando anticorpi monoclonali anti-AFPR ha rivelato la presenza predominante di questo recettore nei cellule tumorali maligne. Successivamente i nostri risultati sono stati confermati dalla ricerca di R. Moro. Pertanto, l’AFPR può fungere da bersaglio unico sulla superficie delle cellule tumorali e i sistemi di rilascio basati sul suo ligando naturale, l’AFP, possono fornire un rilascio selettivo del farmaco a queste cellule. L'analisi del legame e dell'endocitosi dell'AFP marcata con fluorescenza suggerisce un'elevata efficienza e specificità dell'accumulo di AFP nelle cellule tumorali in proliferazione attiva e l'assenza di questo accumulo di proteine ​​nei linfociti non proliferanti.

Uno studio in vitro sull'efficacia antitumorale di una serie di coniugati a base di AFP, in cui sono stati analizzati vari citostatici, antibiotici antitumorali, antimetaboliti, fotosensibilizzatori (doxorubicina, daunomicina, calicheamicina, bleomicina, esperamicina, cisplatino, carbossifosfamide, vinblastina, metotrexato, ftalocianine). utilizzati come componenti citotossici, hanno dimostrato loro un'elevata attività antitumorale selettiva. Il coniugato AFP con esperamicina Aib ha mostrato un'efficacia significativa in esperimenti su modelli in vivo nel trattamento di topi con tumori sperimentali, prevenendo lo sviluppo di tumori e aumentando più volte la durata della vita degli animali. Va notato che questo antibiotico, che appartiene alle enediine, è un composto estremamente tossico. La struttura chimica degli antibiotici enediino condivide un elemento comune, spesso indicato come "testata", che è un anello enediino a 10 membri contenente due legami acetilenici in posizione a rispetto al doppio legame o anello ossiranico. In condizioni fisiologiche e sotto una certa attivazione, una tale "testata" subisce una riorganizzazione in un diradicale reattivo. L'effetto citotossico dell'esperamicina è dovuto all'induzione di rotture del DNA a singolo e doppio filamento. Gli studi clinici su questo farmaco si sono conclusi con un fallimento a causa della sua elevata tossicità sistemica. Forse l’unico modo per sfruttare il potenziale di questo antibiotico è aumentarne la selettività mediante attacco chimico alle molecole vettori, fornendo un rilascio mirato al tumore, cosa che abbiamo fatto.

Va notato che la selezione di un linker che lega la proteina vettore all'agente citotossico è di particolare importanza nella progettazione del CAD. Un citostatico può essere somministrato con successo alla cellula bersaglio, ma se non viene separato tempestivamente dal vettore, l'effetto biologico non verrà realizzato o sarà espresso debolmente. Un'analisi dell'efficacia dei coniugati AFP con DOKS, in cui sono stati utilizzati linker diversi nella loro labilità, ha mostrato che i più attivi erano i coniugati, nella sintesi dei quali sono stati utilizzati glutaraldeide e idrazide dell'acido 3-maleimidobenzoico. L'attività citotossica dei coniugati AFP con DOX era correlata all'accumulo di DOX nei nuclei delle cellule: più velocemente ciò accadeva, più attivo era il coniugato. Quando come linker è stato utilizzato l'estere N-idrossisuccinimmide dell'acido 3-(2-ditiopiridil)propionico, la localizzazione nelle cellule DOX era prevalentemente citoplasmatica, anche un giorno dopo l'applicazione del coniugato. Allo stesso tempo, questo coniugato ha mostrato un'attività molto bassa (25 volte inferiore alla DOX libera). Apparentemente, un forte legame disolfuro impedisce la rapida scissione della DOX negli endosomi. Nelle cellule, gli enzimi capaci di ripristinare il legame disolfuro (tiolo-proteina disolfuro reduttasi, tiolo-proteina disolfuro reduttasi, tioredossina, glutaredossina, gamma-interferone tiolo reduttasi lisosomiale inducibile - GILT) sono localizzati nella cavità microsomiale, nelle strutture del Golgi complesso; La tioredossina e la glutaredossina catalizzano la riduzione dei legami disolfuro nel nucleo e nel citoplasma; GILT - negli endosomi/lisosomi tardivi (pH ottimale 4-5). Il ripristino dei legami disolfuro nelle proteine ​​avviene negli endosomi/lisosomi tardivi dopo una proteolisi limitata da parte delle catepsine. Il ripristino del legame disolfuro mediante l'azione della tiolo-proteina disolfuro reduttasi rallenta significativamente con la diminuzione del pH. Il rilascio di DOX dai coniugati in cui l'antibiotico è legato alla proteina tramite un legame disolfuro sembra essere piuttosto lento, il che spiega la bassa attività citotossica di tali coniugati. Il secondo fattore che potrebbe influenzare l'efficacia del coniugato discusso è la modifica del gruppo amminico del residuo zuccherino della DOX in seguito all'introduzione di un gruppo tiolico utilizzando SPDP. Sebbene numerosi studi abbiano dimostrato la produzione di coniugati attivi di anticorpo DOX utilizzando questa strategia di sintesi, altri studi hanno dimostrato che la modificazione della DOX da parte degli aminozuccheri riduce l'attività citotossica di questo antibiotico e porta ad una perdita dell'attività citotossica dell'antraciclina nell'organismo. coniugare.

Tuttavia, l'uso dell'SPDP nella sintesi dei coniugati AFP-EsA si è rivelato molto efficace. Infatti, la citotossicità del coniugato testato in vitro è risultata per la maggior parte inferiore a quella dell'EA libero. Tuttavia, grazie all'aumento della selettività dell'azione dell'Esa nella composizione del coniugato, è stato possibile ottenere un successo significativo nell'analisi del coniugato in vivo.

I risultati ottenuti consentono di prevedere il livello di efficacia di farmaci mirati basati su molecole vettori proteici. L'efficacia di tali farmaci dipende non solo dalla proteina vettore, ma, in larga misura, dal tipo di legame chimico tra la proteina e l'antibiotico antitumorale. Questa relazione non dovrebbe essere troppo forte, poiché ciò fa perdere i vantaggi della somministrazione mirata: nonostante l'elevata concentrazione intracellulare dell'antibiotico, quest'ultimo potrebbe non avere un effetto farmacologico se non raggiunge il suo bersaglio. Ma la connessione non dovrebbe essere troppo labile, poiché il farmaco deve mantenere la sua integrità prima di interagire con le cellule bersaglio. Allo stesso tempo, quando si crea un costrutto mirato, si deve tenere conto che la scissione del farmaco (antibiotico, citostatico, ecc.) dalla molecola proteica avverrà molto probabilmente negli endosomi a valori di pH di 5,5-6 , cioè il linker che lega la molecola AFP al farmaco deve idealmente essere idrolizzato ai valori di pH indicati oppure essere substrato di enzimi endosomali.

La proprietà più importante dei coniugati sintetizzati a base di AFP era la loro capacità di invertire la resistenza multifarmaco grazie all'attività dei trasportatori ABC.

I risultati ottenuti ci permettono di concludere che l'AFP può essere efficacemente utilizzata come agente mirato per la veicolazione di farmaci antitumorali a cellule tumorali di varia origine.

Forse l’unico inconveniente significativo dell’AFP umana naturale è la fonte del suo isolamento: in quantità preparative, l’AFP può essere isolata solo da materiale abortivo. Nel sangue del cordone ombelicale, il biomateriale che abbiamo utilizzato, il contenuto di AFP è molto più basso e, in effetti, anche questa non è la migliore fonte biologica. Pertanto, ci siamo posti il ​​compito di ottenere un vettore proteico ricombinante: un frammento di AFP contenente un sito di legame del recettore identico a quello della molecola naturale. Il frammento C-terminale ricombinante risultante dell'AFP (gAFP27) si è legato specificamente al recettore dell'AFP sulle cellule tumorali ed è stato endocitato da queste in modo simile all'AFP umana a lunghezza intera. hAFP27 ha mantenuto anche alcune altre proprietà biologiche della proteina a lunghezza intera. L'uso di hAFP27 come vettore nel SAD apre la possibilità di utilizzo pratico del potenziale della proteina come ligando per AFPR.

Le cellule trasformate sono caratterizzate da cambiamenti genetici associati alla regolazione della proliferazione cellulare e dell'apoptosi. Tra i numerosi studi dedicati allo sviluppo di nuovi agenti selettivi per le cellule tumorali, un posto speciale spetta agli oligonucleotidi antisenso. Gli ASON fanno parte di una classe di nuovi agenti in grado di inibire la sintesi di specifiche proteine ​​associate al tumore legandosi all'mRNA che codifica queste proteine, bloccando così la sintesi proteica. Molti ASON modificati (in particolare tiofosfato) in vitro hanno mostrato una diminuzione convincente nell'espressione del gene bersaglio e si prevedeva che avessero successo contro un'ampia gamma di tumori. Un ostacolo che riduce la selettività dell'azione dell'ASON è l'attuale mancanza di SAD adeguata ed efficace di questi composti nelle cellule bersaglio, necessaria per realizzare il potenziale terapeutico dell'ASON.

Le cellule trasformate sono caratterizzate da cambiamenti genetici associati alla regolazione della proliferazione cellulare e dell'apoptosi. Tra i numerosi studi dedicati allo sviluppo di nuovi agenti selettivi per le cellule tumorali, un posto speciale spetta agli oligonucleotidi antisenso. Gli oligonucleotidi antisenso sono una di queste classi di nuovi agenti in grado di inibire la sintesi di proteine ​​specifiche associate al tumore legandosi all'mRNA che codifica queste proteine, bloccando così la sintesi proteica. Negli ultimi decenni sono stati sviluppati e testati diversi antisenso in studi preclinici e clinici. Molti di essi hanno mostrato una diminuzione convincente nell'espressione del gene bersaglio nei sistemi in vitro e si prevedeva che avessero successo in un'ampia gamma di tumori. Tuttavia, a causa dell’eterogeneità genetica dei tumori, l’uso dell’antisenso come unico farmaco non sembra essere efficace nel trattamento delle malattie. Le terapie antisenso mirate alle vie di segnalazione coinvolte nella proliferazione cellulare e nell’apoptosi sono particolarmente promettenti se combinate con trattamenti antitumorali convenzionali.

La consegna del tiofosfato A8(G) alle cellule tumorali sotto forma di coniugati con AFP si è rivelata estremamente efficace, poiché ha permesso di superare la barriera della membrana citoplasmatica, che limita la penetrazione degli ABOI nelle cellule. Questa efficienza si è manifestata sia sotto forma di effetto citostatico diretto sia sotto forma di sensibilizzazione delle cellule bersaglio all'azione di altri farmaci antitumorali.Si è riscontrato che la tossicità aspecifica di alcune sequenze (G) non era un ostacolo all'uso di questi (G) , poiché l'uso di una molecola vettore nel SAD limitava la loro tossicità sulle cellule tumorali. Tuttavia, la sintesi dei coniugati si è rivelata un processo molto laborioso, accompagnato dalla stessa significativa perdita di proteine ​​e ABOB.Costrutti alternativi, che sono i complessi non covalenti di proteine ​​con ABOM, possono essere tecnologicamente più avanzati. Gli OB, in particolare i loro analoghi tiofosfati, hanno un'elevata carica negativa e sono in grado di formare complessi forti con molecole policationiche. Per aumentare l'efficienza della formazione di tali complessi, nelle molecole delle proteine ​​​​ricombinanti (hAFP27 ed EuR) è stata introdotta una sequenza carica positivamente, che garantisce la loro forte interazione con LBM. I costrutti risultanti si sono rivelati SBP di successo, che non solo aumentano notevolmente l'efficienza dell'accumulo di ABOB nelle cellule caratterizzate da un maggiore contenuto di recettori per le proteine ​​di cui sopra, ma proteggono anche i GO fosfodiesteri naturali dalla degradazione. Tuttavia, l’uso di un mitogeno, quale è l’EOP, come componente mirato del SAD, limita la gamma di ABO applicati, impedendo in alcuni casi la realizzazione di un effetto biologico. È possibile che la modifica della regione di legame del recettore della molecola EuR possa aiutare a risolvere questo problema, per cui si perderà la capacità del recettore di attivarsi (la capacità di autofosforilarsi), ma ciò non influisce la capacità del recettore di essere internalizzato dopo essersi legato al suo ligando.

I risultati degli studi sperimentali presentati in questo articolo indicano l'elevata efficienza e selettività dei sistemi di somministrazione mirati basati sull'alfa-fetoproteina, sui suoi frammenti e sul fattore di crescita epidermico modificato.

I progressi nello studio dei meccanismi molecolari alla base della patogenesi delle malattie e l’emergere di nuovi metodi nel campo della biologia molecolare e della biotecnologia aprono opportunità per lo sviluppo di nuovi farmaci che influenzano selettivamente varie vie di segnalazione caratteristiche delle cellule tumorali e, quindi, la possibilità di un trattamento individuale mirato basato su un complesso unico di bersagli molecolari prodotti dal tumore del paziente. I farmaci possono raggiungere il bersaglio da soli (ad esempio, gli anticorpi terapeutici), o come parte di sistemi di somministrazione mirati a specifici organi colpiti dal tumore, o direttamente in superficie o nelle cellule tumorali. Comprendere la biologia cellulare del tumore e studiare il microambiente delle cellule tumorali consentirà lo sviluppo di opzioni efficaci per farmaci mirati.

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L'RNA "antisenso" (RNA antisenso), che dovrebbe essere usato come farmaco, è un oligonucleotide corto (15-20 nucleotidi) che può legarsi a un determinato sito dell'mRNA complementare ad esso e inibire la traduzione della proteina che codifica, sopprimendo così il processo patologico (Fig. 2).

L'effetto terapeutico degli oligonucleotidi sintetici "antisenso" dipende dalla specificità della loro ibridazione con il sito accessibile dell'mRNA bersaglio, dalla resistenza all'azione delle nucleasi cellulari e dalla presenza di un sistema di rilascio nella cellula. Le sequenze di 15-20 nucleotidi si ibridano con mRNA unici con specificità piuttosto elevata. I potenziali siti bersaglio vengono determinati testando una serie di oligonucleotidi "antisenso" utilizzando una coltura cellulare che sintetizza l'mRNA bersaglio. Per fare ciò, viene effettuata la separazione elettroforetica delle proteine ​​cellulari, in cui durante la traduzione viene inclusa un'etichetta radioattiva e, mediante radioautografia, viene determinato in presenza di quale degli oligonucleotidi “antisenso” la sintesi di una determinata proteina viene ridotta. Non esistono criteri generali per selezionare i migliori siti bersaglio nei diversi trascritti di RNA. Possono essere efficaci gli oligonucleotidi che sono complementari alle estremità 5' o 3' dell'mRNA, ai confini dell'esone e dell'introne e persino alle regioni a doppio filamento. Gli oligonucleotidi antisenso possono essere degradati dalle nucleasi intracellulari, quindi è importante proteggerli dall'azione di queste ultime affinché non perdano la capacità di ibridarsi con il bersaglio. Per questo, le basi pirimidiniche, ribosio o desossiribosio possono essere modificate in un certo modo (Fig. 3). Pertanto, negli oligonucleotidi “antisenso” attualmente più utilizzati, l’atomo di ossigeno libero del legame fosfodiestere è sostituito dal gruppo SH (Fig. 3B ), con conseguente formazione di un legame tiofosfato. Gli oligonucleotidi modificati in questo modo si dissolvono in acqua, portano una carica negativa e non vengono scissi dalle endonucleasi. Quando ibridati su un sito bersaglio, formano duplex che attivano la ribonucleasi (RNasi), un enzima endogeno che scinde l'mRNA in tale molecola ibrida. Sono stati condotti i primi studi clinici su tali oligonucleotidi - farmaci di "prima generazione". Gli obiettivi sono l'RNA del citomegalovirus, il virus dell'immunodeficienza umana, nonché l'mRNA dei geni responsabili dello sviluppo del cancro, delle malattie intestinali e di altre malattie.

Oligonucleotidi "antisenso" sintetizzati con legami fosforamiditici e poliammidici (peptidici) - acidi nucleici peptidici (acidi nucleici peptidici, PNA) (Fig. 3 V e D ). Tali molecole sono molto resistenti all'azione delle nucleasi. I gruppi chimici attaccati all'atomo di carbonio 2' del residuo di zucchero e all'atomo C-5 delle pirimidine proteggono anche gli oligonucleotidi antisenso e facilitano il loro legame al sito bersaglio (Fig. 3 2D E E ). Tutti i vantaggi di queste e altre modifiche vengono ora studiati intensamente.

La penetrazione degli oligonucleotidi "antisenso" nella cellula può essere notevolmente facilitata inserendoli nei liposomi. Questo sistema di rilascio altamente efficiente consente l'uso di oligonucleotidi "antisenso" a basse concentrazioni. Se, tuttavia, i liposomi vengono coniugati con anticorpi specifici per gli epitopi di alcune cellule di determinati organi, allora sarà possibile effettuare il rilascio mirato di oligonucleotidi “antisenso”.

Test preclinici condotti hanno dimostrato che gli oligonucleotidi "antisenso" sono farmaci molto efficaci. È stata studiata la possibilità del loro utilizzo per il trattamento della stenosi delle arterie coronarie e carotidi, che porta ad infarti e ictus. In questi casi si ricorre spesso all'angioplastica, espansione delle arterie mediante catetere a palloncino, ma in circa il 40% dei pazienti le stenosi ricompaiono dopo 6 mesi, poiché l'angioplastica stimola la proliferazione delle cellule muscolari lisce e la secrezione di sostanza intercellulare nell'interno strato dell'arteria nel sito della sua espansione. In uno degli esperimenti, oligonucleotidi antisenso con legami tiofosfato, complementari agli mRNA che codificano per proteine ​​importanti per il ciclo cellulare dei mammiferi, sono stati iniettati nelle arterie carotidi dei ratti dopo angioplastica; di conseguenza, la frequenza delle stenosi ricorrenti è diminuita del 90%. La proliferazione delle cellule muscolari lisce si verifica anche nell'aterosclerosi, nel diabete mellito e nelle complicanze dopo un intervento di bypass coronarico. Probabilmente tutti questi stati possono essere controllati in modo simile.

Gli oligonucleotidi antisenso possono essere utilizzati anche per trattare le infezioni virali e la malaria. Inoltre, i risultati degli studi clinici di fase I per il trattamento della malattia di Crohn mediante somministrazione orale dell'oligonucleotide "antisenso" hanno dimostrato un chiaro effetto terapeutico senza effetti collaterali evidenti. In questo caso, l'mRNA bersaglio codifica per l'adesione intercellulare di tipo 1, che viene prodotta in eccesso nei pazienti con malattia di Crohn. Si prevede di studiare l'efficacia dello stesso oligonucleotide per il trattamento di altre malattie infiammatorie, come l'artrite reumatoide, la psoriasi e la colite ulcerosa.

In linea di principio, gli oligonucleotidi "antisenso" possono formare una tripla elica con un DNA cromosomico bersaglio e bloccare la trascrizione. Tuttavia, la specificità degli oligonucleotidi "antigenici" non soddisfa ancora gli standard adottati per i farmaci.

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Ciò può essere ottenuto in diversi modi: ibridazione dell'oligonucleotide corrispondente con un gene o mRNA specifico, bloccando il fattore di trascrizione proteica, riducendo la quantità di mRNA a seguito della scissione da parte degli enzimi dell'RNA, ecc. Considera i principi di alcuni di essi.

Un ribooligonucleotide che si lega a uno specifico mRNA e quindi inibisce la traduzione della proteina che codifica è chiamato mRNA "antisenso". Questo meccanismo viene utilizzato da alcuni batteri per regolare i geni (Fig. 3.20). In pratica vengono utilizzati geni progettati artificialmente, in cui l'inserto di DNA è orientato in modo tale che le loro trascrizioni sono antisenso rispetto all'mRNA bersaglio (Fig. 3.21).


Riso. 3.20. Regolazione del gene della batterioferritina (bfr) mediante RNA antisenso




Riso. 3.21. Inibizione della traduzione dell'mRNA da parte di un oligonucleotide antisenso sintetico


È stato dimostrato che possono essere utilizzati oligonucleotidi antisenso sintetici, tuttavia, il loro effetto terapeutico dipenderà fortemente dalla loro resistenza all'azione delle nucleasi cellulari, dal sistema di rilascio e dalla specificità della loro ibridazione. Per determinare i siti bersaglio più efficaci su uno specifico mRNA, un set di oligonucleotidi antisenso lunghi 15-20 basi viene testato con una coltura di cellule che sintetizzano l'mRNA bersaglio. La composizione delle proteine ​​sintetizzate viene determinata mediante elettroforesi e viene stabilito quale introduzione dell'oligonucleotide porta ad una diminuzione della sintesi della proteina bersaglio.

Per proteggersi dalla scissione della nucleasi, vengono sintetizzati oligonucleotidi modificati, senza perdere la capacità di ibridarsi. Nella fig. 3.22 mostra le strutture dei nucleotidi modificati, la cui efficacia è oggetto di studi approfonditi. Ad esempio, è stato dimostrato che gli oligonucleotidi con la sostituzione dell'ossigeno libero del legame fosfodiestere con lo zolfo (struttura b) si ibridano efficacemente con l'RNA bersaglio complementare e i risultanti duplex RNA-DNA attivano la ribonucleasi H intracellulare.

Questo enzima endogeno idrolizza la sequenza di RNA in tali ibridi. Con tali oligonucleotidi sono già stati condotti studi clinici promettenti, in cui gli obiettivi erano l'RNA del citomegalovirus, dell'HIV e alcuni RNA responsabili dello sviluppo del cancro.



Riso. 3.22. Modifiche oligonucleotidiche: a - normale legame fosfodiestere; b - legame tiofosfato; c - legame fosfammidico; d - 2"-0-metilribosio; e - C-5-propinilcitosina


Per un rilascio efficace degli oligonucleotidi antisenso, questi vengono spesso confezionati in liposomi, che a loro volta vengono modificati con ligandi specifici che forniscono un rilascio mirato (abbiamo già visto questa tecnica quando abbiamo considerato i metodi di rilascio non virale di geni terapeutici). Ad oggi sono stati effettuati numerosi test ed è stata dimostrata un'elevata efficacia terapeutica degli oligonucleotidi antisenso nel sopprimere la proliferazione indesiderata delle cellule muscolari lisce (complicanze dopo angioplastica, intervento di bypass coronarico, aterosclerosi), per il trattamento delle infezioni virali e della malaria .

Il principio di azione e la struttura dei ribozimi - RNA naturale con attività nucleasica, è mostrato in Fig. 3.23.
È stato scoperto che questi RNA a filamento corto sono in grado di sopprimere efficacemente l'espressione di geni virali, oncogeni, fattori di crescita e altri geni terapeuticamente importanti scindendo il loro mRNA. Modificando la sequenza di legame del substrato è possibile ottenere ribozimi specifici per un particolare mRNA. I ribozimi possono essere sintetizzati direttamente nella cellula mediante trascrizione di un oligodeossiribonucleotide sintetico che codifica il dominio catalitico e ibrida le regioni che lo fiancheggiano.



Riso. 3.23. Scissione dell'mRNA da parte dei ribozimi. La freccia mostra il sito di clivaggio.


Un tale oligonucleotide viene inserito in un vettore di espressione eucariotico e posto in una cellula. L'RNA risultante acquisisce spontaneamente una conformazione attiva, la cosiddetta forma a testa di martello. Molti ribozimi di varie strutture e attività sono stati sintetizzati chimicamente. Ad esempio, nel laboratorio degli acidi nucleici dell'Istituto di biologia chimica e medicina sperimentale della filiale siberiana dell'Accademia russa delle scienze (Novosibirsk), vengono condotti molti anni di ricerca per ottenere ribozimi sintetici con maggiore attività e stabilità.

Per aumentare la protezione contro la scissione prematura da parte delle nucleasi intracellulari, si ottengono vari derivati ​​dei ribozimi - con gruppi metilati 2 "-idrossilici (vedi Fig. 3.22, d), strutture binarie, ecc. La struttura della molecola di ribozima influisce in modo significativo sulla sua efficacia. Figura 3.24 mostra la cinetica della scissione dell'mRNA mdr1 con ribozimi sintetizzati di varie strutture.



Riso. 3.24. Scissione del frammento 5'-terminale di 190 mer dell'mRNA di MDR1 con ribozimi binari modificati (1,3) e a lunghezza intera (2,4): a - struttura dell'RNA con un sito specifico isolato; b - accumulo di prodotti di scissione ( materiali forniti da A.G. Venyaminova, IBKhiFM, Novosibirsk)


Un posto speciale nella terapia molecolare è occupato dai cosiddetti metodi di attivazione dei profarmaci. Ad esempio, uno dei metodi di terapia genica per il cancro è la distruzione delle cellule tumorali utilizzando un derivato attivato del ganciclovir (GCV, un derivato della guanosina), un prodotto del gene timidina chinasi, dal virus dell'herpes simplex HSVtk già citato da noi.

Le cellule tumorali vengono trasfettate in vivo con il gene HSVtk sotto un promotore attivo e dopo alcuni giorni viene somministrato ganciclovir, che viene fosforilato dalla timidina chinasi virale a monofosfato e quindi dalle chinasi della cellula ospite a trifosfato. Questo derivato inibisce la DNA polimerasi e blocca la sintesi del DNA, che porta alla morte delle cellule proliferanti. Attraverso i contatti intercellulari, il ganciclovir trifosfato penetra nelle cellule vicine non modificate e distrugge così altre dieci cellule tumorali.

Il gene che porta alla morte della propria cellula è chiamato gene “suicidio” (nel nostro caso è il gene timidina chinasi), e il termine “profarmaco” si riferisce alla forma inattiva del farmaco (in questo caso è ganciclovir). Questo approccio è stato utilizzato per creare altre varianti della combinazione gene attivatore-profarmaco, ma l’efficacia del sistema GCV-HSVtk è già stata dimostrata in numerosi studi preclinici.

La terapia genica è una nuova disciplina medica, la cui formazione avviene davanti ai nostri occhi. Nonostante alcuni successi e prospettive promettenti, restano ancora alcune sfide da superare.

Alcuni dei problemi vanno ben oltre la medicina e la biologia molecolare. Queste sono questioni etiche e politiche. Come avrete già notato, abbiamo considerato i metodi di terapia genetica solo per le cellule somatiche. Ciò significa che le correzioni apportate sono limitate a un determinato organo o tessuto, i geni "corretti" non verranno trasmessi alla generazione successiva. I cambiamenti nel genotipo delle cellule germinali (spermatozoi o ovuli) o delle cellule fecondate devono essere trasmessi di generazione in generazione.

Attualmente, la terapia genica delle cellule somatiche è classificata come un metodo standard di intervento medico. Al contrario, la terapia genica sulle cellule germinali è tecnologicamente molto più complessa, problematica e imprevedibile. Pertanto, gli esperimenti in questo settore sono vietati in molti paesi.

Alla fine degli anni '80. Negli Stati Uniti sono state stabilite norme che disciplinano le sperimentazioni nel campo della terapia genetica delle cellule somatiche. Garantiscono una selezione imparziale e rappresentativa dei pazienti e la loro consapevolezza (quanto è pericoloso il trattamento, qual è la probabilità del suo successo, ecc.), la riservatezza delle informazioni sui pazienti e sugli studi eseguiti, l'attuazione corretta di tutte le manipolazioni senza causare danni , sia a pazienti specifici che alla popolazione umana in generale.

Poiché il trattamento delle cellule somatiche porta ad un miglioramento della condizione e ad un significativo prolungamento della vita dei pazienti con malattie genetiche, ma il gene "migliorato" non viene ereditato, si ritiene che ciò porterà all'accumulo di malattie genetiche nei pazienti la popolazione umana. Tuttavia, secondo la genetica delle popolazioni, sono necessari migliaia di anni affinché, a seguito di un trattamento efficace, si verifichi un aumento significativo della frequenza di un gene dannoso.

SUL. Voinov, T.G. Volova

Un oligonucleotide è un breve pezzo di acido nucleico lungo meno di 50 nucleotidi. Negli ultimi 20 anni il significato si è ampliato fino a includere tutti gli acidi nucleici sintetizzati chimicamente, indipendentemente dalla lunghezza. La prima pubblicazione sulla sintesi chimica mirata di un oligonucleotide apparve nel 1955.

Da allora, ogni anno sono stati sintetizzati milioni di oligonucleotidi da utilizzare nei laboratori di tutto il mondo. La maggior parte degli studi richiede solo piccole quantità di DNA. Quantità molto maggiori di DNA (10 µmol o più) sono necessarie per l'uso negli studi biofisici (NMR e cristallografia a raggi X), quindi per consentire la sintesi di quantità così grandi, sono stati sviluppati metodi di sintesi in fase solida che consentono la uso di oligonucleotidi come molecole di farmaci (ad esempio, oligonucleotidi antisenso).

La sintesi di oligonucleotidi di DNA o RNA si riferisce alla sintesi chimica di frammenti di acido nucleico con strutture o sequenze chimiche definite di varie dimensioni.

Fig. 1. Strutture degli oligonucleotidi.

Il principio della sintesi in fase solida è stato sviluppato e applicato per la prima volta alla sintesi dei polipeptidi da Robert Bruce Merrifield, un biochimico americano che ha ricevuto il Premio Nobel per la Chimica nel 1984 per la sua invenzione della sintesi peptidica in fase solida. Si rese conto che la chiave per una sintesi riuscita stava nell'ancorare il primo monomero alla fase solida polimerica insolubile. Altri monomeri possono poi essere collegati, uno per uno, all'estremità terminale immobile del polimero in crescita. Al termine della sintesi, la catena polimerica completata può essere staccata dal polimero insolubile e purificata. Questo processo è stato ottimizzato nel corso degli anni per essere altamente efficiente ed è ora diventato una tecnica fondamentale utilizzata nei sintetizzatori automatizzati di oligonucleotidi.

Per garantire la riuscita sintesi degli oligonucleotidi, sono necessarie le seguenti condizioni:

  • Tutti i reagenti devono essere solubili in solventi non acquosi.
  • I gruppi aminici e ossidrilici delle basi nucleotidiche e dei residui carboidratici devono essere opportunamente bloccati.
  • I gruppi protettivi introdotti durante la sintesi devono essere stabili in condizioni di allungamento della catena durante la formazione di un legame fosfodiesterico internucleotidico.
  • I gruppi protettivi devono essere sufficientemente labili in modo da poter essere rimossi al termine della sintesi senza danneggiare i prodotti di reazione.

Funzioni degli oligonucleotidi e prospettive per la loro applicazione

Attualmente, gli oligonucleotidi e i loro analoghi sono ampiamente utilizzati in vari campi, come la medicina e la ricerca biologica molecolare, e sono anche considerati promettenti agenti terapeutici e sonde per la diagnostica molecolare.

Negli ultimi 20 anni, solo due tipi di analoghi dell'acido nucleico con una struttura formalmente elettricamente neutra, gli acidi nucleici peptidici e gli oligonucleotidi morfolino fosfodiammide, sono stati relativamente ben studiati. Gli analoghi di entrambi i tipi sono in grado di legarsi in modo complementare alle molecole naturali di DNA e RNA, e quindi hanno trovato applicazione sia nella biologia molecolare che, in particolare, in medicina come potenziali farmaci.

Inoltre, con lo sviluppo delle tecnologie del DNA, è diventato possibile studiare l'espressione di geni conosciuti, determinare mutazioni nei genomi di vari organismi e diagnosticare una serie di malattie infettive. Per risolvere questi problemi, il più promettente è l’uso dei chip di DNA, che sono piccole piastre con frammenti di DNA depositati sulla loro superficie.

Il metodo per creare chip di DNA combina metodi basati sulla sintesi mirata di oligonucleotidi direttamente sulla superficie del chip. La sintesi viene effettuata mediante aggiunta graduale alla catena oligonucleotidica crescente di nucleotidi contenenti un gruppo protettivo labile all'estremità 5', la cui rimozione è possibile sotto l'azione di radiazione luminosa, tensione elettrica o durante l'idrolisi acida.

È stato anche dimostrato che, a seconda del gene bersaglio selezionato, gli oligonucleotidi mirati al gene hanno una significativa varietà di effetti modulanti sui tessuti tumorali, che vanno dal rallentamento e arresto della proliferazione delle cellule tumorali fino alla soppressione delle loro proprietà invasive.

I farmaci antitumorali a base di acidi nucleici sono uno strumento altamente specifico per modulare l’espressione genica. La soppressione di un numero di geni che sono sovraespressi in modo anomalo durante la trasformazione neoplastica può essere ottenuta con farmaci a base di acidi nucleici come gli oligonucleotidi antisenso (asON). In generale, il meccanismo di soppressione dell'espressione genica consiste nel loro legame complementare con l'mRNA bersaglio, dopo di che l'mRNA bersaglio viene tagliato o il suo processo di traduzione viene bloccato.

Gli asON sono DNA sintetici a filamento singolo lunghi 15-20 nucleotidi. Recentemente sono stati ottenuti asON che possono impedire il trasporto dell'mRNA di splicing dal nucleo al citoplasma, nonché asON che, a seguito del blocco del sito di splicing nel pre-mRNA, possono portare all'espressione di un variante proteica alternativa.

A causa del fatto che gli oligodeossiribonucleotidi naturali nella coltura cellulare e in condizioni in vivo subiscono una rapida degradazione sotto l'azione delle nucleasi, nella struttura asON vengono introdotte varie modifiche chimiche per aumentarne la stabilità.

Sintesi chimica degli oligonucleotidi

La sintesi in fase solida è ampiamente utilizzata nella sintesi peptidica, nella sintesi oligonucleotidica, nella sintesi oligosaccaridica e nella chimica combinatoria. La sintesi chimica in fase solida fu inventata negli anni '60 da Bruce Merrifield e vinse il Premio Nobel per la Chimica nel 1984.

La sintesi in fase solida viene effettuata su un supporto solido, tra filtri, in colonne che consentono il passaggio di tutti i reagenti e solventi. La sintesi in fase solida presenta una serie di vantaggi rispetto alla sintesi in soluzione:

 fornisce un'elevata velocità di reazione

 Le impurità e i reagenti in eccesso vengono lavati via, quindi non è necessaria la pulizia dopo ogni passaggio

 il processo è suscettibile di automazione su sintetizzatori in fase solida controllati da computer.

I supporti solidi (chiamati anche resine) sono particelle insolubili in acqua, tipicamente di 50-200 µm di diametro, a cui è attaccato un oligonucleotide durante la sintesi.

È dimostrato che uno dei materiali più efficaci che possono essere utilizzati come supporto solido è il vetro poroso. È abbastanza rigido e non è in grado di gonfiarsi. Nei suoi pori profondi avviene la sintesi degli oligonucleotidi. Il vetro contiene pori da 500 Å (50 nm), adatti alla sintesi di oligonucleotidi corti. Tuttavia, è poco adatto per la sintesi di oligonucleotidi di lunghezza superiore a 40 basi. Ciò è dovuto al fatto che l'oligonucleotide in crescita blocca i pori e riduce la diffusione dei reagenti attraverso la matrice.

I supporti solidi per la sintesi oligonucleotidica convenzionale sono tipicamente realizzati con un carico di 20-30 µmol di nucleosidi per grammo di resina. La sintesi di oligonucleotidi a carichi più elevati diventa meno efficiente a causa dell'ingombro sterico tra filamenti di DNA adiacenti attaccati alla resina.

Fasi della sintesi chimica degli oligonucleotidi

L'oligosintesi del fosforamidato procede nella direzione da 3' a 5' (opposta alla direzione da 5' a 3' della biosintesi del DNA nella replicazione del DNA). Viene aggiunto un nucleotide per ogni ciclo di sintesi.

Riso. 2. Ciclo di sintesi degli oligonucleotidi fosforamidati

All'inizio della sintesi dell'oligonucleotide, il primo nucleoside viene pre-attaccato alla resina (supporto) e le colonne di sintesi A, G, C o T vengono selezionate a seconda del nucleoside all'estremità 3' dell'oligonucleotide desiderato. Il nucleoside ancorato ha un gruppo protettivo 5'-DMT (DMT=4,4'-dimetossitritile) il cui ruolo è quello di impedire la polimerizzazione e questo gruppo protettivo deve essere rimosso (detritilazione). Il meccanismo di detrializzazione è mostrato nella Figura 3.

Fig.3. Meccanismo di rimozione del gruppo di protezione.

Dopo la detritilazione, il nucleoside ancorato è pronto a reagire con la base successiva, che viene aggiunta come monomero nucleosidico fosforammidato. Un grande eccesso del nucleoside corrispondente viene miscelato con un attivatore (tetrazolo o suoi derivati). Il gruppo diisopropilamminico del nucleoside viene protonato dall'attivatore e diventa quindi un gruppo altamente staccabile. Viene rapidamente spostato dal gruppo 5′-idrossile del nucleoside legato, creando un triestere fosfito (Fig. 4).

Fig.4. Il meccanismo di protonazione da parte di un attivatore.

I fosforamiditi nucleosidici sono abbastanza stabili in un'atmosfera inerte e possono essere prodotti in grandi quantità, spediti in tutto il mondo e conservati come solido secco per diversi mesi prima dell'uso.

Tuttavia, anche con un lavoro di sintesi oligonucleotidica di alta precisione, rimane la possibilità che ci siano alcuni gruppi 5′-idrossile non reagiti che saranno disponibili per partecipare alla fase successiva. Se tale interruzione non viene interrotta, si accumuleranno ad ogni ciclo successivo e il prodotto finale sarà una miscela complessa di oligonucleotidi, la maggior parte dei quali conterrà informazioni genetiche errate.

Pertanto il metodo di acetilazione dei gruppi 5'-idrossili li rende inerti rispetto alla successiva reazione. Ciò è necessario anche per ridurre al minimo le impurità.

Il fosfito triestere (P(III)) formato nella fase di addizione è instabile agli acidi e deve essere convertito nella forma stabile (P(V)). Ciò si ottiene grazie all'ossidazione dello iodio in presenza di acqua e piridina (Fig. 5). Il fosfotriestere risultante è in realtà un asse del DNA protetto da un gruppo 2-cianoetile. Il gruppo cianoetile previene reazioni indesiderate con il fosforo durante i successivi cicli di sintesi.

Fig.5. Il meccanismo della fase ossidativa.

Successivamente, il gruppo protettivo DMT all'estremità 5' del filamento di DNA deve essere rimosso in modo che il gruppo ossidrile primario possa reagire con il successivo nucleotide fosforammidato. La reazione di deprotezione con acido tricloroacetico in diclorometano è rapida. Il ciclo viene ripetuto, una volta per ciascuna base, fino ad ottenere l'oligonucleotide desiderato.

Successivamente è necessario staccare l'oligonucleotide sintetizzato dal supporto solido. In questo caso viene utilizzato il succinile. La separazione è possibile se trattata con ammoniaca acquosa concentrata a temperatura ambiente per un'ora (Fig. 6).

Fig.6. Meccanismo di separazione di un oligonucleotide da un supporto solido in una soluzione acquosa concentrata di ammoniaca.

Su alcuni sintetizzatori la reazione di scissione viene eseguita automaticamente e la soluzione di ammoniaca contenente l'oligonucleotide entra in una fiala di vetro. In alternativa, la digestione può essere eseguita manualmente prelevando la colonna dal sintetizzatore e sciacquandola in siringhe contenenti idrossido di ammonio.

L'oligonucleotide viene sciolto in ammoniaca acquosa concentrata e il successivo riscaldamento consente la rimozione dei gruppi protettivi dalle basi eterocicliche e dai fosfati. La soluzione acquosa viene quindi allontanata per evaporazione e l'oligonucleotide è pronto per la purificazione.

Oltre al gruppo protettivo DMT, sono necessari ulteriori gruppi protettivi anche per adenina, citosina e guanina (Fig. 7). Tuttavia, questo non è necessario per la timina.

Fig.7. Strutture di gruppi protettivi comunemente utilizzate per proteggere le basi di adenina, citosina e guanina durante la sintesi del fosforamide degli oligonucleotidi del DNA.

conclusioni

1. Gli oligonucleotidi sintetizzati artificialmente sono sempre più utilizzati in vari campi della scienza e i metodi per la loro preparazione vengono sempre più migliorati, il che rende possibile sintetizzare un numero sufficiente di oligonucleotidi per esperimenti di laboratorio e per la creazione di farmaci terapeutici.

2. Ad oggi, il metodo più comune per la sintesi degli oligonucleotidi è il metodo di sintesi in fase solida, che può accelerare significativamente il processo di ottenimento degli oligonucleotidi, nonché ridurre la quantità di reagenti esauriti.

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    Medicina per i geni

    Il sogno di lunga data dei medici è quello di avere a disposizione sostanze che agiscano su geni specifici, ad es. la causa principale di molte malattie. Infatti, sulla base di tali sostanze, è possibile creare farmaci - veri e propri "proiettili magici" che possono influenzare il materiale ereditario di vari agenti infettivi senza danneggiare il corpo umano, oltre a sopprimere l'attività degli oncogeni responsabili della crescita delle cellule maligne. La creazione di tali sostanze che hanno un effetto diretto sul materiale genetico è uno dei compiti principali della biologia molecolare, poiché possono essere utilizzate per studiare le funzioni dei geni e, in definitiva, controllare il lavoro di questi ultimi.

    Ma come si può modificare il programma genetico desiderato? Dopotutto, tutti i geni hanno composizione e struttura chimica simili: le differenze tra loro si riducono solo all'ordine di alternanza di quattro blocchi monomerici: nucleotidi A, T, G, C. Per agire su un determinato gene, una molecola di sostanza Dobbiamo in qualche modo riconoscere questa sequenza nucleotidica: il compito, a prima vista, irrisolvibile.

    Ma un gruppo di chimici siberiani che vennero all'Academgorodok di Novosibirsk nei primi anni della sua creazione la pensavano diversamente. Sulla base del principio del riconoscimento molecolare utilizzato dalla natura stessa, i dipendenti dell'Istituto di Chimica Organica della Filiale Siberiana dell'Accademia delle Scienze dell'URSS (Novosibirsk) N.I. Grineva e i gruppi D.G. I chimici siberiani pubblicarono il loro primo lavoro sugli oligonucleotidi nel 1967: questa data è oggi considerata la data ufficiale dell'emergere di una nuova direzione nella biologia molecolare e nella farmacologia.

    Sono stati i primi

    L'attuazione di questo progetto, insolito nella sua audacia (a quel tempo non era nemmeno previsto di svolgere tale ricerca in nessuna parte del mondo) nella fase iniziale è stata realizzata da un piccolo gruppo di giovani dipendenti, dottorandi e studenti di NSU. Bisognava cominciare praticamente da zero, perché a quel tempo non si sapeva ancora come sintetizzare gli oligonucleotidi in quantità apprezzabili; non esistevano strumenti tecnici necessari per lavorare con piccole quantità di acidi nucleici e un metodo efficace per determinarne la sequenza. I nostri chimici sono riusciti a risolvere questi problemi grazie all'interdisciplinarietà, uno dei principi che hanno costituito la base delle attività del ramo siberiano.

    Il NIOC ha organizzato la produzione di acidi nucleici, ha sviluppato metodi per la loro modificazione chimica; insieme ai dipendenti dell'Istituto di fisica nucleare, è stato possibile creare dispositivi per l'analisi degli acidi nucleici e la manipolazione con piccole quantità e, insieme ai chimici dell'Università statale di Mosca, hanno iniziato a lavorare sulla creazione di sintetizzatori automatici di oligonucleotidi. Di conseguenza, praticamente tutti i metodi e gli strumenti analitici necessari erano a disposizione degli scienziati: la ricerca biologica poteva iniziare.

    Esperimenti condotti prima su modelli semplici e poi su acidi nucleici naturali hanno dimostrato che gli oligonucleotidi interagiscono effettivamente con gli acidi nucleici bersaglio con un elevato grado di selettività. Nel caso in cui gruppi reattivi siano attaccati agli oligonucleotidi, avviene una modificazione chimica mirata degli acidi nucleici bersaglio. Inoltre è stato dimostrato per la prima volta che questi reagenti possono essere utilizzati per sopprimere le infezioni virali negli animali ed è stata dimostrata la possibilità di introdurli nell'organismo attraverso la pelle, le mucose, ecc.

    Le prime pubblicazioni sugli effetti biologici prodotti dagli oligonucleotidi suscitarono grande interesse tra gli specialisti di tutto il mondo. Nel 1988 si è tenuto ad Akademgorodok il primo simposio al mondo sulle sostanze mirate ai geni basate su frammenti di acido nucleico. Scienziati provenienti da Stati Uniti, Francia e poi altri paesi si sono uniti al lavoro sulla creazione di tali farmaci; Sono emerse dozzine di aziende con l'obiettivo di creare farmaci terapeutici basati su oligonucleotidi.

    Medicina complementare

    I cosiddetti oligonucleotidi antisenso, progettati per l’inattivazione selettiva degli RNA virali e di alcuni RNA cellulari, sono diventati i primi farmaci mirati ai geni. Inizialmente si presumeva che a questi oligonucleotidi sarebbero stati attaccati gruppi reattivi che avrebbero dovuto modificare o distruggere chimicamente gli acidi nucleici bersaglio. Tuttavia, si è scoperto che l'attaccamento degli oligonucleotidi all'RNA bersaglio di per sé ha un effetto così forte su di esso che può provocarne la distruzione da parte degli enzimi cellulari.

    D. G. KNORRE - Accademico dell'Accademia Russa delle Scienze, specialista nel campo della cinetica chimica, della biologia molecolare e della chimica bioorganica. Capo del Laboratorio di Chimica dei Polimeri Naturali (1960-1984), Dipartimento di Biochimica e Laboratorio di Chimica degli Acidi Nucleici (1970-1984) dell'Istituto di Chimica Organica della Sezione Siberiana dell'Accademia delle Scienze dell'URSS, Direttore dell'Istituto di Chimica Bioorganica della Sezione Siberiana dell'Accademia delle Scienze dell'URSS e della Sezione Siberiana dell'Accademia Russa delle Scienze (1984-1996). ) Gli approcci antisenso basati sull'uso di nucleotidi e acidi nucleici per sopprimere l'attività biologica degli acidi nucleici offrono prospettive interessanti nei casi in cui è necessario sopprimere l'implementazione di informazioni indesiderate negli organismi viventi. Innanzitutto si apre la prospettiva di creare una nuova generazione di farmaci antivirali e antitumorali. Tali farmaci hanno un vantaggio indiscutibile rispetto ad altri... Tutti gli oligonucleotidi, indipendentemente dall'obiettivo a cui sono mirati, possono essere creati utilizzando un'unica tecnologia. Solo la sequenza dei nucleotidi deve essere variata. In particolare, in virologia e oncologia, spesso si deve affrontare un fenomeno come l'emergere della resistenza ai farmaci. Ciò accade molto spesso perché una singola particella virale o una singola cellula tumorale presenta una mutazione che porta a tale resistenza. In ogni altro caso, dovrebbe essere avviata una ricerca empirica per un nuovo farmaco. Nel caso degli effetti antisenso è solo necessario determinare quale cambiamento nella struttura del genoma virale o dell'oncogene ha portato alla comparsa della resistenza. Successivamente, diventa immediatamente chiaro come creare un nuovo farmaco utilizzando la stessa tecnologia unificata *.

    * Diario educativo di Soros. - 1998. - 12. - C. 25-31.

    Gli RNA interferenti, brevi complessi a doppio filamento di oligonucleotidi di RNA, si sono rivelati il ​​mezzo più potente per "spegnere" i geni. Quando un tale complesso viene introdotto in una cellula, uno dei filamenti si lega alla sua sequenza complementare nell'RNA messaggero della cellula. Questo serve come segnale per avviare il lavoro di un gruppo di enzimi che tagliano l'RNA associato agli oligonucleotidi. Di conseguenza, il programma per la sintesi di una determinata proteina scompare.

    Nel 2006, due ricercatori americani hanno ricevuto il Premio Nobel per la Fisiologia e la Medicina per aver spiegato il meccanismo dell'interferenza dell'RNA. La creazione di regolatori dell'espressione genica basati su RNA interferenti ha aperto grandi opportunità per ottenere una vasta gamma di farmaci non tossici altamente efficaci che sopprimono l'espressione di quasi tutti i geni, compresi quelli tumorali e virali.

    Mutazioni corrette

    L'attenzione degli specialisti è stata a lungo attratta dai metodi di azione mutagena sul DNA utilizzando oligonucleotidi o loro derivati. In caso di successo, ciò che oggi sembra una fantasia potrebbe diventare realtà: la correzione di programmi genetici difettosi.

    È già stato dimostrato sperimentalmente che le mutazioni puntiformi possono essere introdotte nei programmi genetici utilizzando oligonucleotidi corti. Come farlo? Gli oligonucleotidi mutageni contenenti blocchi nucleotidici "sbagliati" vengono introdotti nella cellula, dove vengono combinati con il DNA. Di conseguenza, in alcune parti delle sequenze nucleotidiche compaiono coppie di basi “sbagliate”, cioè non complementari, che vengono percepite dal sistema di riparazione (“riparazione”) del DNA cellulare come un danno. I nucleotidi in tale coppia vengono sostituiti da enzimi riparativi in ​​modo tale da diventare “corretto”, complementare. In questo caso la sostituzione può avvenire sia nella sequenza oligonucleotidica che nel DNA cellulare stesso.

    In quest’ultimo caso si tratta di un cambiamento nel programma genetico, cioè di una mutazione. E sebbene l’efficienza di un simile processo di mutazione sia generalmente bassa, può essere utilizzata in relazione a nuove tecnologie cellulari. Ad esempio, le cellule staminali di un paziente affetto da qualche malattia ereditaria possono essere trattate con un mutageno selettivo, e poi quelle in cui si è verificata la mutazione desiderata (cioè cellule con un programma genetico “corretto”) possono essere selezionate, moltiplicate e introdotto nel corpo.

    1967 Viene pubblicato il primo lavoro sugli oligonucleotidi, sostanze biologicamente attive mirate ai geni

    Pertanto, gli oligonucleotidi attualmente esistenti sono in grado di regolare il “lavoro” dei geni a vari livelli. Pertanto, i suddetti oligonucleotidi antisenso e gli RNA interferenti funzionano nella fase di sintesi proteica, agendo sugli RNA messaggeri - molecole informative in cui sono assemblate le catene polipeptidiche. Gli oligonucleotidi antigenici che formano complessi con il DNA sopprimono l'espressione genica: la formazione degli stessi RNA messaggeri e gli oligonucleotidi aptameri, come gli anticorpi, possono formare legami con determinate proteine, bloccandole. Inoltre, alcuni oligonucleotidi sono in grado di stimolare il sistema immunitario: oggi vengono utilizzati come componenti dei vaccini.

    Attualmente, lo sviluppo e la sintesi degli oligonucleotidi e dei loro analoghi sono portati avanti da ampi settori industriali e di ricerca. Quindi, l'anno scorso, il volume del mercato degli oligonucleotidi destinati solo a scopi di ricerca ha superato gli 800 milioni di dollari! Sono stati sviluppati e sintetizzati decine di nuovi tipi di oligonucleotidi modificati chimicamente e sono in fase di sperimentazione numerosi farmaci antivirali e antinfiammatori basati su di essi. Ricerche di questo tipo in Russia vengono ora svolte principalmente presso l'Istituto di biologia chimica e medicina fondamentale della filiale siberiana dell'Accademia russa delle scienze, dove lavorano studenti e seguaci dell'accademico D. G. Knorre.

    È così che la vita stessa ha dimostrato la fecondità dell'idea nata nel ramo siberiano quarant'anni fa. Utilizzando brevi frammenti di acidi nucleici come strutture di base per creare sostanze biologicamente attive mirate ai geni, è possibile sviluppare rapidamente e introdurre nella produzione farmaci specifici contro quasi tutti i virus. Per fare ciò, è solo necessario decifrare la sequenza nucleotidica dei geni virali, cosa facile da fare con l'aiuto delle moderne tecnologie. Questo approccio universale ha un grande futuro: i risultati di studi recenti, in particolare sulla mutagenesi sito-diretta, permettono di contare sulla comparsa nel prossimo futuro di farmaci efficaci per combattere malattie ancora considerate incurabili.





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